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    本報(bào)訊 近日，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院油料作物研究所芝麻與特色油料遺傳育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)在國際知名學(xué)術(shù)刊物《核酸研究》（Nucleic Acids Research）上發(fā)布了植物微衛(wèi)星DNA及其標(biāo)記開發(fā)數(shù)據(jù)庫PMDBase。該數(shù)據(jù)庫的創(chuàng)建和共享將為全球作物功能基因組學(xué)和分子育種研究提供全面而便利的基礎(chǔ)平臺。

    微衛(wèi)星DNA，也稱為SSR，是涉及許多重要生物功能的基因組成分，已被廣泛地應(yīng)用于作物基礎(chǔ)研究，包括遺傳多樣性、連鎖和關(guān)聯(lián)作圖、標(biāo)記輔助選擇、品種鑒定和進(jìn)化分析等。

    據(jù)介紹，該團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一套便捷高效的微衛(wèi)星DNA位點(diǎn)鑒定及分子標(biāo)記開發(fā)流程，對截至目前已完成基因組測序的110個(gè)植物進(jìn)行了鑒定，共發(fā)掘微衛(wèi)星DNA位點(diǎn)26,230,099個(gè)，并為每個(gè)位點(diǎn)開發(fā)了3對引物。用戶可獲取目標(biāo)物種有用的微衛(wèi)星DNA位點(diǎn)和引物信息，以及每個(gè)位點(diǎn)所屬物種、位置、起止、類型、大小以及序列信息。用戶可以利用數(shù)據(jù)庫進(jìn)行微衛(wèi)星DNA位點(diǎn)在線鑒定及分子標(biāo)記在線設(shè)計(jì)。該數(shù)據(jù)庫還提供了多種檢索方式和下載功能，所有數(shù)據(jù)和分析結(jié)果都可下載。

    該數(shù)據(jù)庫為全球研究者們提供了在線的、友好的、便利的植物微衛(wèi)星DNA鑒定平臺，是目前國際上涵蓋最多植物物種和信息最全面的綜合性數(shù)據(jù)庫，填補(bǔ)了同領(lǐng)域相關(guān)研究空白。