近日,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究所李杏種質(zhì)改良團(tuán)隊(duì)與桃種質(zhì)資源團(tuán)隊(duì)聯(lián)合破譯了中國李高質(zhì)量基因組,并于9月2日將其研究成果發(fā)表于《植物學(xué)雜志(The Plant Journal)》上。
中國李高質(zhì)量基因組的破譯,意味著中國李重要經(jīng)濟(jì)性狀改良得到遺傳學(xué)基礎(chǔ)的奠定。論文第一作者黃振宇博士介紹:“得到基因組信息之后,我們后續(xù)再去定位、發(fā)掘中國李的關(guān)鍵性狀相關(guān)基因等等都需要用到這個(gè)序列的信息,這是我們順利開展遺傳學(xué)分析和基因定位等工作的先決條件。”
黃振宇介紹,此次關(guān)于中國李高質(zhì)量基因組的破譯從設(shè)想到試驗(yàn)完成,歷時(shí)整整3年時(shí)間,在這個(gè)過程中,研究團(tuán)隊(duì)準(zhǔn)備中國李的根、莖、葉、花、果實(shí)等樣品,提取高質(zhì)量DNA與RNA,進(jìn)行高深度測(cè)序,將得到的初始數(shù)據(jù)進(jìn)行多輪組裝校正,最后破譯出中國李高質(zhì)量基因組,并對(duì)70余份中國李核心種質(zhì)進(jìn)行高深度重測(cè)序,再分析其群體遺傳與進(jìn)化特征,黃振宇說:“我們目前獲得的結(jié)果為深度解析中國李的基因組變異規(guī)律、優(yōu)異基因發(fā)掘及分子輔助育種體系構(gòu)建奠定了重要基礎(chǔ)?!?/p>
中國李(Prunus salicina L.)是世界上商業(yè)化栽培最廣泛的李種之一,適應(yīng)性強(qiáng),具有較高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值與生態(tài)價(jià)值。其適應(yīng)性極強(qiáng),在我國南至廣東省、北至黑龍江省,均有大面積栽培。黃振宇指出,團(tuán)隊(duì)研究的最終目的,就是選育出具有優(yōu)質(zhì)、抗病、廣適的中國李。“與歐洲李常被用來深加工不同,中國李更多的經(jīng)濟(jì)價(jià)值在于鮮食,我們按照功能性來進(jìn)行不同方向的研究?!?/p>