記者從中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院油料作物研究所獲悉，該所油料作物基因組學(xué)與抗病性改良創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)前不久破譯了油菜基因組的全轉(zhuǎn)錄信息密碼，構(gòu)建了油菜十萬(wàn)余個(gè)基因的轉(zhuǎn)錄全景圖，至此油菜基因功能研究第一次有了標(biāo)準(zhǔn)的可參考的基因轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)庫(kù)。該研究成果已于近日在線發(fā)表于學(xué)術(shù)期刊《植物學(xué)報(bào)》。
?。▓D為油菜功能基因轉(zhuǎn)錄信息實(shí)例圖，中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院油料作物研究所供圖）
據(jù)團(tuán)隊(duì)首席科學(xué)家、中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院油料作物研究所研究員劉勝毅介紹，隨著科技的發(fā)展，人類(lèi)對(duì)各種作物的了解越來(lái)越深入。其中，基因庫(kù)的建立對(duì)農(nóng)業(yè)科技的發(fā)展至關(guān)重要。此前，水稻、玉米、小麥等主要作物，都已經(jīng)建立了基因庫(kù)。如今，油菜也有了基因庫(kù)。
劉勝毅說(shuō)，油菜基因組包含約12億個(gè)堿基和十余萬(wàn)個(gè)基因，如何解讀這些海量的基因組信息，成為功能基因研究的重要任務(wù)?；蚴峭ㄟ^(guò)轉(zhuǎn)錄形成mRNA再翻譯成蛋白質(zhì)。由于基因的轉(zhuǎn)錄通常存在多種可變的剪切方式，從而一個(gè)基因可以形成許多種不同的mRNA。
此前，由于技術(shù)和資源的限制，油菜一直缺乏全基因組水平所有基因的轉(zhuǎn)錄mRNA數(shù)據(jù)庫(kù)，導(dǎo)致油菜基因功能研究缺乏可查詢和可參考的基因注釋信息。為了突破這一瓶頸，劉勝毅團(tuán)隊(duì)采用最新的三代測(cè)序技術(shù)，準(zhǔn)確測(cè)定了油菜全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組，并自主開(kāi)發(fā)了一套用于多倍體油菜復(fù)雜基因組的分型方法，繪制了油菜基因組的轉(zhuǎn)錄全景圖，構(gòu)建了油菜“標(biāo)準(zhǔn)”的參考轉(zhuǎn)錄本數(shù)據(jù)庫(kù)。
來(lái)自中國(guó)農(nóng)科院的消息稱，該研究成果更新了人們對(duì)油菜基因和基因組的認(rèn)識(shí)和理解，將為甘藍(lán)型油菜功能基因和遺傳改良研究、以及基因組設(shè)計(jì)育種提供數(shù)據(jù)基礎(chǔ)和理論指導(dǎo)，有力支撐油菜功能基因的相關(guān)研究工作。
