據(jù)中國(guó)農(nóng)科院最新消息，該院植物保護(hù)研究所作物黃萎病研究團(tuán)隊(duì)與美國(guó)加州大學(xué)戴維斯分校聯(lián)合牽頭的“全球黃萎病菌基因組研究”計(jì)劃取得重要進(jìn)展，搭建了國(guó)際上第一個(gè)作物黃萎病菌資源和基因組數(shù)據(jù)庫(kù)（Verticilli-Omics），并正式上線(xiàn)。用戶(hù)可在該網(wǎng)站查閱收錄的菌種資源信息、測(cè)序基因組可視化展示、數(shù)據(jù)挖掘和分析等。
團(tuán)隊(duì)首席戴小楓研究員介紹，黃萎病被稱(chēng)為植物“癌癥”。作為引起黃萎病的病原真菌，大麗輪枝菌是一種毀滅性的土傳病原真菌，可侵染包括棉花、馬鈴薯、多種蔬菜瓜果和林木等在內(nèi)的600多種植物，年均造成損失近百億美元；與馬鈴薯晚疫病并列為世界頭號(hào)檢疫對(duì)象。該病原難以防控的重要原因是種群結(jié)構(gòu)復(fù)雜，農(nóng)業(yè)生產(chǎn)實(shí)踐中缺少分子流行檢測(cè)技術(shù)。
針對(duì)這一難題，團(tuán)隊(duì)聯(lián)合國(guó)內(nèi)外16家科研機(jī)構(gòu)開(kāi)展協(xié)同攻關(guān)，構(gòu)建了迄今為止來(lái)源最豐富的菌種資源庫(kù)，發(fā)起了“全球黃萎病菌基因組研究”計(jì)劃。目前已完成基因組解析工作（全基因組159株、重測(cè)序3624株），搭建了Verticilli-Omics數(shù)據(jù)庫(kù)1.0版本并開(kāi)始線(xiàn)上運(yùn)行。該數(shù)據(jù)庫(kù)收錄了來(lái)源于10個(gè)國(guó)家的26個(gè)寄主共8102份黃萎病菌菌種資源；釋放了159個(gè)大麗輪枝菌全基因組數(shù)據(jù)，占目前全球已釋放大麗輪枝菌基因組總數(shù)的85%；搭建了基因組可視化、基因功能檢索、基因比對(duì)等分析平臺(tái)。團(tuán)隊(duì)目前還在搭建Verticilli-Omics數(shù)據(jù)庫(kù)2.0版本，主要展示全球大麗輪枝菌遺傳變異組數(shù)據(jù)。
該項(xiàng)研究得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃政府間國(guó)際科技創(chuàng)新合作重點(diǎn)專(zhuān)項(xiàng)、中國(guó)農(nóng)科院科技創(chuàng)新工程等項(xiàng)目支持。
