11月25日，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院果樹研究所梨資源與育種創(chuàng)新團隊完成了梨矮化砧木品種——‘中矮1號’高質(zhì)量基因組的測序與組裝。該參考基因組的成功組裝，不僅為今后解析梨矮化、早果等性狀形成的分子機制奠定基礎(chǔ)，也為其他性狀研究和比較基因組學(xué)研究提供了詳實有效的參考數(shù)據(jù)，在梨基因組學(xué)研究和分子輔助育種方面將發(fā)揮重要作用。相關(guān)研究成果在線發(fā)表在《科學(xué)數(shù)據(jù)（Scientific Data）》上。
據(jù)姜淑苓研究員介紹，‘中矮1號’是我國自主選育的第一個梨矮化砧木新品種，其作中間砧木具有促進嫁接樹矮化、早果和豐產(chǎn)等優(yōu)點，在梨矮化密植栽培和矮化砧木育種中發(fā)揮著重要作用；同時，‘中矮1號’源于‘錦香’梨（南果梨×巴梨）實生后代，遺傳背景復(fù)雜，基因組代表性廣。該研究以‘中矮1號’為試材，以PacBio三代測序技術(shù)為主，Illumina二代測序技術(shù)為輔進行了全基因組測序和組裝，并通過Hi-C技術(shù)將組裝的contig掛載到染色體水平。該研究最終獲得了一個510.59 Mb的參考基因組，contigN50為1.28 Mb，其中，506.31 Mb（99.16%）的序列被掛載到17條染色體上，已知順序和方向的序列為427.18 Mb，占預(yù)測基因組大小的（511.33 Mb）83.5%。該基因組還成功預(yù)測了309.86 Mb (60.68%) 的重復(fù)序列和43,120個蛋白編碼基因，是繼該團隊杜梨基因組后的另一個高質(zhì)量梨參考基因組。
該研究得到中國農(nóng)科院科技創(chuàng)新工程和中央級公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)費項目資助。（通訊員 何文上）
原文鏈接：https://www.nature.com/articles/s41597-019-0291-3
