隨著高通量測(cè)序技術(shù)的不斷發(fā)展，上萬(wàn)種生物的全基因組DNA序列被測(cè)序完成。其基因組的注釋主要基于預(yù)測(cè)軟件和已知蛋白的同源搜索，不可避免地導(dǎo)致編碼蛋白質(zhì)基因的錯(cuò)誤注釋和丟失、假基因廣泛存在。另外，由于缺少肽段等信息，大量基因被注釋為未知功能或假設(shè)的蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)基因組（Proteogenomics）是一種利用蛋白質(zhì)組學(xué)的相關(guān)數(shù)據(jù)對(duì)基因組進(jìn)行注釋校正的新方法，由于其結(jié)合了大量生物體蛋白質(zhì)氨基酸信息，從而有力地彌補(bǔ)基因組上基因?qū)ふ液妥⑨尩牟蛔?。小菜蛾是一種世界性重要農(nóng)業(yè)害蟲(chóng)，每年因小菜蛾造成的損失高達(dá)40億–50億美元。小菜蛾幾乎對(duì)所有的殺蟲(chóng)劑均產(chǎn)生了不同程度的抗藥性，包括微生物殺蟲(chóng)劑Bt。該團(tuán)隊(duì)利用鳥(niǎo)槍法高效液相色譜-電噴霧-質(zhì)譜/質(zhì)譜（shotgun HPLC-ESI-MS/MS）對(duì)小菜蛾幼蟲(chóng)中腸蛋白質(zhì)進(jìn)行測(cè)定，結(jié)合其基因組數(shù)據(jù)，完成了首個(gè)小菜蛾中腸蛋白質(zhì)基因組分析。利用獲得的小菜蛾BBMV蛋白質(zhì)譜圖，鑒定到了大量與小菜蛾殺蟲(chóng)劑抗性相關(guān)的蛋白質(zhì)，同時(shí)，還糾正了小菜蛾的基因注釋?zhuān)b定了大量新基因以及新的基因剪切形式。
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