蔬菜所科研團(tuán)隊(duì)揭示黃瓜性別決定奧秘
近日,從中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所獲悉,該所蔬菜功能基因組學(xué)創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)與國內(nèi)外同行合作,發(fā)現(xiàn)了一個(gè)大片段DNA序列拷貝數(shù)變化可以決定黃瓜的性別。相關(guān)成果于5月22日在國際著名期刊《植物細(xì)胞(Plant Cell)》發(fā)表。
大片段DNA序列的結(jié)構(gòu)變異(Structural Variation,簡稱SV)包括插入/缺失、拷貝數(shù)變化和倒位等多種類型,可引起許多人類疾?。ㄈ缱蚤]癥和精神分裂癥)的發(fā)生,在植物中也有關(guān)于結(jié)構(gòu)變異引起農(nóng)藝性狀(如葉子大小和果實(shí)形狀)改變的少量報(bào)道,但是植物中結(jié)構(gòu)變異產(chǎn)生的機(jī)制及其對基因功能的影響還鮮有報(bào)道。
該團(tuán)隊(duì)在2013年構(gòu)建了黃瓜全基因組變異圖譜的基礎(chǔ)上,繼續(xù)利用這些數(shù)據(jù)深入開展了黃瓜SV的鑒定和分析工作,鑒定了近2.7萬個(gè)SV位點(diǎn),涉及約1200萬個(gè)堿基,影響近1700個(gè)基因的功能,并揭示了SV產(chǎn)生的主要機(jī)制,將成為研究黃瓜基因功能的重要資源,并為充分利用SV改良作物提供了理論基礎(chǔ)。
黃瓜是典型的雌雄異花作物,多數(shù)黃瓜品種同時(shí)有雌花和雄花,只有雌花可發(fā)育成果實(shí)。在歐洲有些品種為全雌系,整個(gè)植株全部開雌花,因此具有較高的增產(chǎn)潛力。黃瓜全雌系產(chǎn)生的性別決定機(jī)制一直是國內(nèi)外研究熱點(diǎn),多個(gè)研究團(tuán)隊(duì)圍繞該問題做了大量探索,但一直未得到十分明確的答案。該研究發(fā)現(xiàn)黃瓜全雌系是由于一個(gè)30kb大小DNA片段的拷貝數(shù)增加引起,并且發(fā)現(xiàn)拷貝數(shù)增加應(yīng)該最初發(fā)生在東亞的一個(gè)黃瓜材料中,后來傳播到歐洲,形成產(chǎn)量較高的黃瓜品種。黃瓜全雌系產(chǎn)生遺傳機(jī)制的揭示對于進(jìn)一步揭示性別決定機(jī)理具有重要的指導(dǎo)意義,并對將來培育高產(chǎn)黃瓜品種具有潛在的重要應(yīng)用價(jià)值。
該研究得到了國家杰出青年科學(xué)基金項(xiàng)目 、國家優(yōu)秀青年科學(xué)基金項(xiàng)目、國家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目、科技部973項(xiàng)目及中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程的資助。(通訊員 李海芬)
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